MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Geobacillus sp. JF8 plasmid pBt40

Total Repeats: 189

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022092	A	6	6	6	11	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_022092	CAAAG	2	10	40	49	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
3	NC_022092	AG	3	6	75	80	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_022092	AGA	2	6	135	140	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_022092	AGC	2	6	309	314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_022092	AAG	2	6	319	324	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_022092	ATTG	2	8	357	364	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_022092	GCA	2	6	372	377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_022092	TCA	2	6	429	434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_022092	CAT	2	6	460	465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_022092	CG	3	6	513	518	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12	NC_022092	GTTT	2	8	522	529	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_022092	GAA	2	6	622	627	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_022092	TTC	2	6	653	658	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_022092	TTG	2	6	661	666	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_022092	ATC	2	6	1567	1572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_022092	TTG	2	6	2952	2957	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_022092	T	6	6	2967	2972	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_022092	AGG	2	6	2976	2981	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_022092	AGG	2	6	3519	3524	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_022092	AAT	2	6	3528	3533	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_022092	TAC	2	6	3770	3775	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_022092	GGA	3	9	4654	4662	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_022092	CA	3	6	5655	5660	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_022092	A	6	6	5762	5767	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_022092	TGTA	2	8	5805	5812	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_022092	GCA	2	6	5836	5841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_022092	TAA	2	6	6682	6687	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_022092	A	7	7	6694	6700	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_022092	ATA	2	6	6719	6724	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_022092	AGA	2	6	6725	6730	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_022092	GGGA	2	8	6738	6745	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
33	NC_022092	ATG	2	6	7659	7664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_022092	CTT	2	6	8997	9002	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_022092	GCC	2	6	9010	9015	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_022092	AGTT	2	8	9034	9041	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_022092	CAT	2	6	9115	9120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_022092	GGTTT	2	10	9160	9169	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
39	NC_022092	A	6	6	9189	9194	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_022092	TC	3	6	9263	9268	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_022092	AG	3	6	9278	9283	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_022092	T	6	6	9994	9999	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_022092	AC	3	6	10645	10650	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_022092	G	6	6	10749	10754	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
45	NC_022092	AC	3	6	10777	10782	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_022092	T	6	6	10881	10886	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_022092	AAAG	2	8	10893	10900	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_022092	CAT	2	6	10950	10955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_022092	A	6	6	10956	10961	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_022092	TCA	2	6	10980	10985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_022092	A	6	6	11008	11013	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_022092	AAT	2	6	11039	11044	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_022092	AGG	2	6	11067	11072	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_022092	CTT	2	6	11132	11137	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_022092	GTAAAG	2	12	11282	11293	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_022092	T	6	6	11365	11370	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_022092	T	7	7	11396	11402	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_022092	T	6	6	11409	11414	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_022092	TCG	2	6	11436	11441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_022092	TTAT	2	8	12391	12398	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_022092	CAAA	2	8	12417	12424	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_022092	A	6	6	12422	12427	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_022092	TAT	2	6	12457	12462	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_022092	T	6	6	14026	14031	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_022092	A	6	6	14042	14047	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_022092	TA	3	6	14170	14175	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_022092	AAATT	2	10	14244	14253	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_022092	AGG	2	6	14276	14281	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_022092	T	6	6	20018	20023	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_022092	TAT	2	6	20787	20792	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_022092	GAA	2	6	20904	20909	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_022092	AAT	2	6	20972	20977	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_022092	AGT	2	6	20981	20986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_022092	TTA	2	6	21004	21009	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_022092	A	7	7	21051	21057	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_022092	GCA	2	6	21071	21076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_022092	TTC	2	6	22823	22828	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_022092	T	6	6	22872	22877	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_022092	ATG	2	6	22907	22912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_022092	ACC	2	6	23134	23139	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_022092	CTTTTA	2	12	24000	24011	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_022092	AAG	2	6	24012	24017	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_022092	AGG	2	6	24061	24066	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_022092	T	6	6	24296	24301	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_022092	A	6	6	24309	24314	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_022092	T	6	6	24328	24333	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_022092	GAT	2	6	24342	24347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_022092	TAT	2	6	24414	24419	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_022092	CGG	2	6	24453	24458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_022092	TTG	2	6	24568	24573	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_022092	ACA	2	6	24624	24629	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_022092	TCC	2	6	24643	24648	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_022092	TGAT	2	8	24706	24713	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
94	NC_022092	ATCAT	2	10	24865	24874	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
95	NC_022092	TAA	2	6	24913	24918	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_022092	CTA	2	6	24919	24924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_022092	AATC	2	8	24958	24965	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
98	NC_022092	CGA	2	6	24994	24999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_022092	TTCT	2	8	25106	25113	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
100	NC_022092	AGCA	2	8	25127	25134	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
101	NC_022092	ATA	2	6	25146	25151	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_022092	CGA	2	6	25158	25163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_022092	CCCT	2	8	26507	26514	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
104	NC_022092	AAC	2	6	26523	26528	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_022092	ATGCAA	2	12	26538	26549	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_022092	AC	3	6	26596	26601	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
107	NC_022092	TCC	2	6	26708	26713	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_022092	ATTT	2	8	26714	26721	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_022092	A	6	6	27003	27008	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_022092	CAT	2	6	27021	27026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_022092	CGG	2	6	27036	27041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_022092	AGC	2	6	27049	27054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_022092	ATT	2	6	27227	27232	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_022092	GAT	2	6	27254	27259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_022092	AGC	2	6	27271	27276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_022092	CTT	2	6	27292	27297	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_022092	GCAG	2	8	27334	27341	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
118	NC_022092	CTT	2	6	27342	27347	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_022092	GGC	2	6	27405	27410	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_022092	CTTC	2	8	28092	28099	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_022092	A	7	7	28152	28158	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_022092	CCT	2	6	29351	29356	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
123	NC_022092	CAT	2	6	29370	29375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_022092	A	6	6	29417	29422	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_022092	A	6	6	29424	29429	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_022092	GCC	2	6	29442	29447	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
127	NC_022092	TCAT	2	8	29473	29480	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
128	NC_022092	A	7	7	30104	30110	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_022092	T	6	6	30151	30156	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_022092	CGATT	2	10	30171	30180	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
131	NC_022092	TAA	2	6	30268	30273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_022092	A	6	6	30292	30297	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_022092	T	6	6	30728	30733	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_022092	AGA	2	6	30786	30791	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_022092	GAA	2	6	30803	30808	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_022092	GCT	2	6	31963	31968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_022092	AGC	2	6	32009	32014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_022092	CAT	2	6	32020	32025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_022092	CTT	2	6	32030	32035	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_022092	ACA	2	6	32039	32044	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_022092	TAA	2	6	32064	32069	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_022092	GTAT	2	8	32082	32089	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
143	NC_022092	CAA	2	6	32090	32095	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_022092	TTC	2	6	32116	32121	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_022092	TTC	2	6	32129	32134	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_022092	T	6	6	32144	32149	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_022092	CCG	2	6	32199	32204	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
148	NC_022092	CGT	2	6	32231	32236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_022092	T	6	6	32256	32261	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_022092	TTAA	2	8	32366	32373	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_022092	AT	3	6	32378	32383	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_022092	CAG	2	6	32402	32407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
153	NC_022092	TTG	2	6	32420	32425	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
154	NC_022092	TA	3	6	32430	32435	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_022092	TAT	2	6	32440	32445	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_022092	TAT	2	6	32464	32469	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_022092	TTTA	2	8	32490	32497	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_022092	AAATA	2	10	32676	32685	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NC_022092	A	7	7	32747	32753	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
160	NC_022092	T	6	6	32775	32780	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
161	NC_022092	TAG	2	6	32814	32819	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
162	NC_022092	GGA	2	6	32822	32827	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
163	NC_022092	GA	3	6	33987	33992	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
164	NC_022092	GGGA	2	8	34051	34058	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
165	NC_022092	TGA	2	6	34061	34066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
166	NC_022092	GTTC	2	8	36395	36402	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
167	NC_022092	GAA	2	6	36403	36408	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
168	NC_022092	GCT	2	6	36474	36479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
169	NC_022092	AAT	2	6	36522	36527	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
170	NC_022092	TCTTT	2	10	36571	36580	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
171	NC_022092	GCC	2	6	36648	36653	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
172	NC_022092	TTCA	2	8	36703	36710	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
173	NC_022092	CGC	2	6	36737	36742	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
174	NC_022092	CCG	2	6	36787	36792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
175	NC_022092	AAT	2	6	36798	36803	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
176	NC_022092	TAT	2	6	36810	36815	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
177	NC_022092	T	6	6	36815	36820	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
178	NC_022092	CGA	2	6	36849	36854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
179	NC_022092	T	6	6	37072	37077	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
180	NC_022092	AAT	2	6	37861	37866	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
181	NC_022092	TGCC	2	8	37943	37950	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
182	NC_022092	ATA	2	6	37994	37999	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
183	NC_022092	T	6	6	38048	38053	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
184	NC_022092	TTA	2	6	38061	38066	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
185	NC_022092	CT	3	6	38099	38104	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
186	NC_022092	AG	3	6	38113	38118	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
187	NC_022092	AC	3	6	39574	39579	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
188	NC_022092	ATAA	2	8	39630	39637	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
189	NC_022092	TTAA	2	8	39647	39654	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.